Если пропали все панели в Ubuntu на рабочем столе – панель задач с программами и часами, то попробовать запустить терминал (Ctrl +Alt + T), либо подключиться к компьютеру по SSH, и выполнить следующие команды:

rm -rf ~/.config/compiz-1/compizconfig/*
shutdown -r now

После этого панели должны снова появиться.

Команды выполняйте на свой страх и риск.